Морфологическая верификация: определение термина, специфические особенности
Предположить характер новообразования в организме можно благодаря клиническим и рентгенологическим симптомам, а вот определить его гистогенетическую принадлежность можно только благодаря морфологической верификации диагноза. Основной задачей такой диагностики является перепроверка онкологического диагноза для его подтверждения и подбора эффективного курса химиотерапии.
Морфологическая верификация
Услышав впервые от доктора о необходимости проведения морфологической диагностики, многие не имеют представления, что это и для чего проводится.
Верификация является важным исследованием, без которого невозможно принять решение о дальнейших действиях. Морфологическая верификация — это медицинская процедура, которая помогает подтвердить или опровергнуть онкологический диагноз. Чтобы провести исследование, необходимо получить материал. Его выбор в основном зависит от локализации образования.
После проведения исследования специалист в зависимости от результата определяет дальнейшую тактику лечения, которая может быть консервативной или хирургической. Только после морфологического подтверждения может планироваться адекватное лечение. Показанием для проведения верификации являются объемные образования или диффузные изменения органа или его структур. Для проведения морфологического исследования забор ткани осуществляется следующим образом:
Разбился градусник в квартире: возможные последствия, как…
Градусник для измерения температуры тела — медицинский прибор, который сегодня есть в каждой семье….
- при поверхностных изъявленных опухолях берется соскоб и мазки-отпечатки;
- при неглубоко размещенных узловых образованиях проводится пункция;
- при невозможности взятия пункции проводится биопсия с забором участка ткани;
- после неудачных попыток верификации всеми перечисленными выше методами проводится открытая биопсия.
Морфологическая верификация диагноза практически ничем не отличается от цитологической пункции. Чтобы взять материал на исследование, сначала человеку проводят анестезию мягких тканей и кожного покрова, после этого выполняется незначительный разрез кожи, через который внедряется специальный инструмент в мягкие ткани и непосредственно в ткань опухоли. Все последующие действия напрямую зависят от используемого прибора.
Методы верификации
Стандартным вариантом гистологической верификации диагноза является забор тончайших срезов биопсийных тканей для последующего микроскопического исследования. Благодаря им получается полезная информация о составе опухоли.
Морфологическая верификация опухоли проводится следующими способами:
- гистохимией;
- иммуногистохимией;
- иммунофлюоресценцией;
- иммуноферментным анализом.
Независимо от того, какая методика для проведения исследования будет выбрана, целью верификации является не только определение разновидности опухоли, но и оценка клеточных модификаций. По результатам исследования появляется возможность безошибочно принять решение и выбрать тактику лечения.
Гистохимическое исследование
С помощью гистохимической методики можно получить ценную информацию о функциональной активности образования, его типе и гистогенезе. Данный метод позволяет точно поставить диагноз и решить вопрос его дифференциальности.
Разбился градусник в квартире: возможные последствия, как…
Градусник для измерения температуры тела — медицинский прибор, который сегодня есть в каждой семье….
В расположении гистохимии находятся многочисленные реакции, которые оказывают содействие выявлению разных классов веществ.
Иммуногистохимия
ИГХ является методом визуализации, который помогает определить локализацию веществ в препаратах тканевых срезов. В основе данного метода лежит принцип характерного взаимодействия антигенов с антителами, полученными особенным методом.
Иммунофлуоресценция
Метод исследования основан на чувствительности флюоресцентной микроскопии и специфичности иммунологической реакции. В процессе его проведения опухолевая ткань метится специальным красителем, который помогает доктору точно определить диагноз. Особенностью этого метода является простота и необходимость использования минимального количества изучаемого материала.
Иммуноферментный анализ
Метод диагностики обладает высокой восприимчивостью и позволяет устанавливать минимальные количества вещества. В современных методах диагностики именно с помощью этого способа определяется локализация антигена. Для проведения анализа используются специальные ферменты для обнаружения рака.
Рекомбинантная ДНК: описание, структура
Рекомбинантная ДНК — это молекулы, образованные лабораторными методами генетической…
Независимо от выбранной методики целью любого морфологического исследования считается точное определение типа опухоли и оценки изменений на клеточном уровне. Можно сказать простыми словами, что морфологическая верификация — это определение разновидности опухоли и ее запущенности для правильного выбора тактики лечения.
Методы получения материала для морфологического исследования
Для морфологической верификации диагноза необходимо получить материал. Сделать это можно следующими способами:
- Трепан-биопсия – считается одной из самых результативных процедур, несмотря на то что имеет определенные недостатки. Для взятия материала используются специальные иглы с внутренними режущими механизмами. С их помощью получается столбик ткани из опухоли. Этот метод позволяет провести морфологическую верификацию молочных желез, предстательной железы, легкого, печени, позвоночника и лимфатических узлов.
- Инцизионная биопсия – самый популярный метод, который выполняется с помощью скальпеля, которым берется материал из центра подозрительных участков, по периферии опухоли. При этом обязательно нужно делать это вне зон отека, некроза и кровоизлияния грануляционной ткани.
- Эксцизионная биопсия – суть такого метода заключается в полном радикальном удалении опухоли. Этот способ применим только если новообразование имеет небольшие размеры. В таком случае этот способ наиболее предпочтителен, так как имеет как диагностическое, так и терапевтическое значение.
Выбор способа морфологической верификации определяет лечащий врач в зависимости от особенностей сложившейся ситуации.
Последовательность морфологических изменений
Что это такое морфологическая верификация диагноза, и в какой последовательности происходят изменения в процессе развития рака, знают не многие. К сожалению, в основном люди начинают интересоваться подобной информацией, только когда сталкиваются с проблемой.
Онкология в процессе развития проходит определенные стадии, и в результате проведения морфологической верификации доктор может наблюдать разные нюансы развития. При верификации могут обнаруживаться следующие изменения в тканях:
- диффузная и очаговая гиперплазия – процесс не опасный и обратимый;
- метаплазия – доброкачественное новообразование;
- дисплазия – предраковое образование;
- рак in situ – преинвазивное раковое поражение;
- микроинвазия;
- прогрессирующий рак с метастазированием.
Промежутки времени между перечисленными этапами индивидуальны и в каждом отдельном случае могут варьироваться от нескольких месяцев до десятилетий.
Главной задачей морфологической диагностики является установление тканевой принадлежности опухоли. При этом выявляется не только ее наличие и разновидность, но и скрупулезно оценивается степень атипии клетки и нарушение тканевых структур. Чаще всего проводится морфологическая верификация щитовидной железы, молочной, предстательной, печени, почек и позвоночника. Метод проведения исследования в каждом отдельном случае определяется персонально.
Признаки и диагностика рака молочной железы (груди)
Реальный путь улучшения результатов лечения опухолей молочных желез — ранняя, а в ряде случаев, доклиническая диагностика. Решить эту проблему можно только при условии применения комплексных методов диагностики.
Диагностика рака молочной железы состоит из двух этапов:
- первичная
- уточненная диагностика.
К первичной диагностике относятся самообследование пациенток и индивидуальный осмотр врачами различных специальностей.
При изучении анамнеза необходимо выяснить сроки появления первых признаков заболевания и темп их развития. Дисгормональные гиперплазии, послеродовые маститы и травмы, первичное бесплодие, раннее начало менструаций и позднее наступление менопаузы, позднее начало половой жизни и ее нерегулярность, первые роды в зрелом возрасте, отягощенная наследственность, гинекологические заболевания, гипотиреоз, ожирение играют значительную роль в развитии рака молочной железы.
При самообследовании и осмотре следует обращать внимание на симметричность, размеры и форму молочных желез, уровень стояния сосков, деформации молочной железы, состояние кожи, соска и ареолы молочной железы. Наличие втяжения соска, его деформации, мацерация (набухание) или эрозия соска и ареолы (при раке Педжета), кровянистые выделения из соска, наличие деформации молочной железы, втяжения кожи на различных участках молочной железы (симптом «умбиликации»), частичный или тотальный отек кожи (симптом «лимонной» или «апельсинной корки»), уплотнение ткани молочной железы (инфильтрация) должны сразу же насторожить саму пациентку или врача на предмет наличия злокачественной опухоли молочной железы. Осмотр следует проводить при опущенных руках, затем при отведенных руках и руках, закинутых за голову.
Вслед за осмотром производится пальпация, причем следует одинаково тщательно прощупывать обе молочные железы, а не только железу с выявленными при осмотре изменениями, так как весьма нередки случаи двухстороннего поражения молочных желез раком. Вначале ощупывают молочные железы в положении стоя. Изучают состояние сосков и ареол, утолщение или уплотнение, наличие или отсутствие выделений из сосков, их характер. Особенное внимание следует обратить на кровянистые выделения из соска, которые являются патогномоничным симптомом для внутрипротоковой папилломы и рака молочной железы.
Осторожно собирая кожу молочной железы в складки, выявляют наличие либо отсутствие кожных симптомов — патологической морщинистости, «площадки» или умбиликации. После поверхностной пальпации более глубоко изучают состояние молочных желез. При этом ткань молочных желез последовательно захватывают между пальцами во всех отделах, а также производят исследование кончиками пальцев. Это дает возможность выявить ограниченный участок уплотнения или опухоль в молочной железе. При обнаружении уплотнения или опухоли этот участок молочной железы придавливают ладонью к грудной стенке (удобнее при этом стоять позади больной). Если уплотнение не исчезает, это свидетельствует о наличии рака или фиброаденомы (симптом Кенига). В положении больной стоя определяются форма, размеры, консистенция, поверхность, отношение опухоли к окружающим тканям, ее подвижность, болезненность.
После исследования в вертикальном положении больную следует уложить на кушетку и повторить осмотр в положении на спине и на боку в той же последовательности. Уменьшение или исчезновение уплотнения в молочной железе свидетельствуют о его доброкачественной природе (симптом Кенига). Смещение опухоли вслед за соском при потягивании за последний говорит о злокачественной природе опухоли (симптом Прибрама).
После тщательного исследования молочных желез производятся осмотр и пальпация регионарных зон (подмышечных, надключичных и подключичных областей) с обеих сторон с целью выявления возможно существующих метастазов в лимфатические узлы.
В первичной диагностике рака молочной железы следует помнить о нескольких его клинических формах:
- узловая;
- диффузная;
- болезнь Педжета.
Наиболее часто встречается узловая форма опухоли, которая может быть уницентрической (наличие одного узла в молочной железе) и мультицентрической (наличие двух и более узлов). Для этой формы характерны наличие четко определяемого узла (узлов) в молочной железе, как правило, безболезненного, плотная консистенция опухоли, ограниченная подвижность или неподвижность опухоли в молочной железе, нечеткие контуры опухоли, патологическая морщинистость или втяжение кожи над опухолью, определяемые при сдвигании кожи над узлом.
В подмышечной области с той же стороны могут пальпироваться один или несколько плотных подвижных лимфатических узлов округлой формы. В более поздних стадиях могут иметь место втяжение и фиксация соска, определяемая на глаз умбиликация кожи над опухолью, явления лимфостаза, т.
Диффузный рак объединяет отечно-инфильтративную, панцирную, рожеподобную и маститоподобную формы. Эти формы характеризуются быстрым развитием процесса как в самой молочной железе, так и в окружающих тканях, обширным лимфогенным и гематогенным метастазированием, чрезвычайной злокачественностью, крайне плохим прогнозом. Из всех диффузных форм наиболее торпидно протекает панцирный рак.
Отечно-инфильтративный рак встречается чаще в молодом возрасте, нередко при беременности и лактации. Характеризуется диффузным уплотнением части, а иногда и всей ткани молочной железы. Кожа молочной железы, сосок и ареола пастозны и отечны, выражены гиперемия и симптом «лимонной корки». Пальпируется инфильтрат без четких контуров, занимающий большую часть или всю молочную железу. Отек обусловливается блокадой лимфатических путей самой молочной железы метастатическими эмболами или их сдавлением опухолевым инфильтратом. Отечно-инфильтративный рак следует дифференцировать от узловой формы рака молочной железы, сопровождающейся значительным вторичным лимфостазом, обусловленным метастазами в регионарных зонах.
Панцирный рак характеризуется опухолевой инфильтрацией как самой ткани молочной железы, так и покрывающей ее кожи.
Молочная железа сморщивается, подтягивается кверху, уменьшается в размерах.
Рожеподобный рак сопровождается выраженной гиперемией кожи с неровными, языкообразными краями, которые могут распространяться на кожу грудной стенки. Кожа железы покрыта красными пятнами, что обусловлено распространением опухолевых клеток по капиллярам и лимфатическим сосудам (карциноматозный лимфангит). Чаще заболевание протекает остро, с высокой температурой (39-40°С). Эта форма рака плохо поддается лечению. Еще более бурным течением характеризуется маститоподобная форма рака, при котором молочная железа значительно увеличена в размерах, напряжена, плотная, ограниченно подвижна, выражены гиперемия и гипертермия кожи. В глубине железистой ткани пальпируются диффузные уплотнения. Процесс распространяется быстро, часто сопровождается лихорадкой.
Диффузные формы рака, особенно воспалительные, следует дифференцировать от острых форм мастита.
Болезнь Педжета составляет до 5 % всех случаев рака молочной железы. Начинается с покраснения и утолщения соска, появления сухих и мокнущих корочек и струпиков. При их отпадении обнаруживается влажная, зернистая поверхность. В процесс медленно вовлекается ареола. Постепенно сосок уплощается, изъязвляется, процесс распространяется за пределы ареолы на кожу молочной железы. Одновременно идет распространение опухоли по протокам вглубь молочной железы. Рак Педжета характеризуется относительно торпидным течением и относительно благоприятным прогнозом. Следует дифференцировать с псориазом или экземой соска.
Таким образом, первичная диагностика клинических форм рака молочной железы при внимательной и тщательной трактовке выявленных изменений позволяет у большинства больных поставить правильный диагноз. Однако в ряде случаев, правильная клиническая оценка диагноза бывает затруднена. В этом случае на помощь клиницисту приходят инструментальные и лабораторные методы исследования, то есть проводится уточняющая диагностика.
Одним из ведущих методов диагностики различных форм рака молочной железы является рентгенологическое исследование — маммография. Исследование проводят в двух проекциях:
- прямой;
- боковой.
При маммографии различают первичные и вторичные признаки злокачественности. Первичными и основными рентгенологическими признаками рака молочной железы является наличие опухолевой тени и микрокальцинатов. Наиболее четко тень опухоли дифференцируется у женщин старшей возрастной группы на фоне инволютивно измененной ткани молочной железы. Тень опухоли, как правило, неправильной, звездчатой или амебовидной формы, с неровными нечеткими контурами, характерной радиарной тяжистостью.
Очень часто опухолевый узел сопровождается «дорожкой» к соску и втяжением последнего, утолщением кожи железы, иногда с ее втяжением. Однако следует отметить, что некоторые формы ограниченно растущего узлового рака (медуллярный, слизистый) могут давать на маммограммах округлую овальную тень с четкими, но полициклическими контурами, а иногда и без таковых. В этих случаях весьма затруднена дифференциальная диагностика между раком, фиброаденомами, и ограниченно растущими саркомами молочной железы.
Одним из наиболее достоверных и ранних признаков рака является наличие микрокальцинатов, являющихся отображением отложения солей в стенке протока. Иногда микрокальцинаты являются единственным рентгенологическим проявлением раннего рака молочной железы. Обычно микрокальцинаты имеют мелкоклеточный характер (размерами <1 мм), напоминая песчинки. Чем их больше и чем они мельче, тем больше вероятность рака. Микрокальцинаты могут встречаться и при мастопатии и даже в норме, однако, их характер значительно отличается от вышеописанного: их немного, они значительно крупнее (> 3-5 мм.), более бесформенные и глыбчатые.
К вторичным (косвенным) рентгенологическим признакам рака молочной железы относят симптомы со стороны кожи, соска, окружающей ткани молочной железы, усиление васкуляризации и т.д.
Несмотря на эффективность рентгенологического метода, разрешающая способность маммографии у ряда больных резко снижается: при выраженных диффузных формах мастопатии, у молодых пациенток с плотными молочными железами, при наличии имплантатов, выраженных воспалительных изменениях, отеке железы и фоновых заболеваниях типа фиброаденоматоза. В этом случае на помощь врачу приходит ультразвуковое исследование (УЗИ) молочных желез. УЗИ — абсолютно безвредный метод исследования, что позволяет применять его многократно в процессе мониторинга и скрининга.
При УЗИ опухоль выявляется в виде гиперэхогенной зоны округлой формы с неровными контурами. Однако в самостоятельном виде УЗИ обладает сравнительно низкой информативностью, особенно при минимальных размерах опухоли, поэтому его следует применять в комплексе с другими методами диагностики, особенно у молодых женщин с плотными молочными железами и выраженными фоновыми заболеваниями.
Высоко информативным и быстро развивающимся методом диагностики является радиоизотопное исследование молочных желез — сцинтимаммография. При сцинтимаммографии возможно выявление непальпируемых опухолей, мультицентричности роста, опухолей малых размеров, а также возможно одновременное выявление регионарных метастазов.
В последнее время весьма широко используется метод СВЧ-радиотермосканирования (СВЧ-РТС) молочных желез, основанный на оценке градиента температуры ткани на глубине 7-14 см в дециметровом диапазоне волн.
Завершающим этапом уточняющей диагностики является морфологическое (цитологическое и/или гистологическое) исследование. Морфологическая верификация рака необходима при любом подозрении на злокачественный процесс в молочной железе. Материал для цитологического исследования получают при пункции опухоли, выделениях из соска, соскобе с соска при раке Педжета. Практически во всех клиниках гистологическое исследование наиболее точно верифицирует истинную природу заболевания. Показаниями к гистологическому исследованию являются: отсутствие цитологической верификации рака, подозрение на злокачественное новообразование, выявление на маммограммах непальпируемых новообразований, подозрительных на рак.
Таким образом, диагностика рака молочной железы, хотя и не представляет значительных трудностей, должна строиться на всесторонней и полной оценке всех клинических, лабораторных, инструментальных и морфологических данных, что позволит выработать адекватную лечебную тактику и максимально улучшит непосредственные и отдаленные результаты терапии.
Подход на основе спектра локальных морфологических паттернов для автономной проверки подписи
Подход на основе спектра локальных морфологических паттернов для автономной проверки подписи
- B.H. Shekar 18 ,
- R.K. Bharathi 19 и
- Bharathi Pilar 20
- 90 бумага для конференции
1556 доступов
8 Цитаты
Часть серии книг Lecture Notes in Computer Science (LNIP, том 8251)
Abstract
В этой статье мы представляем подход, основанный на спектре локальных морфологических паттернов, для автономной проверки подписи. Предлагаемый подход состоит из трех основных этапов: предварительная обработка, извлечение признаков и классификация. На этапе извлечения признаков изображение подписи разбивается на восемь вертикальных блоков одинакового размера, и получаются спектры локальных морфологических паттернов каждого блока. Спектр, полученный таким образом для каждого блока, преобразуется в нормализованную десятиразрядную гистограмму и формируется вектор признаков сигнатуры. Для классификации используется мера расстояния перемещения земли (EMD), а производительность измеряется с помощью метрики FAR/FRR. Были проведены эксперименты со стандартными наборами данных сигнатур, а именно CEDAR и GPDS-160, а также MUKOS, набором данных на региональном языке (каннада). Сравнительное исследование также проводится с хорошо известными подходами, чтобы продемонстрировать эффективность предлагаемого подхода.
Ключевые слова
- Спектры шаблонов
- Расстояние Earth Movers
- Сопоставление гистограммы
- Проверка подписи в автономном режиме
Скачать документ конференции в формате PDF
Ссылки
Чен С., Шрихари С.: Использование внешних контуров и элементов формы при проверке подписи в автономном режиме. В: ICDAR, стр. 1280–1284 (2005)
Google ученый
Феррер, М., Алонсо, Дж., Травьесо, К.: Геометрические параметры в автономном режиме для автоматической проверки подписи с использованием арифметики с фиксированной точкой. IEEE-PAMI 27(6), 993–997 (2005)
CrossRef Google ученый
Калера, М.К., Шрихари, С., Сюй, А.: Автономная проверка подписи и идентификация с использованием дистанционной статистики. IJPRAI 18, 228–232 (2004)
Google ученый
Латецкий, Л.Дж., Ли, К.Н., Бай, X., Лю, В.Ю.: Скелетирование с использованием ssm преобразования расстояния. В: IEEE-ICIP, vol. 5, стр. 349–352 (2007)
Google ученый
Марагос, П.: Спектр шаблонов и многомасштабное представление формы. IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence 11(7), 701–716 (1989)
CrossRef МАТЕМАТИКА Google ученый
Пал, С., Алиреза, А., Пал, У., Блуменштейн, М.: Автономная идентификация подписи с использованием фоновой и основной информации. В: ICDICTA, стр. 672–677. IEEE (2011)
Google ученый
Руис-Дель-Солар, Дж., Девиа, К., Лонкомилла, П., Конча, Ф.: Проверка подписи в автономном режиме с использованием местных точек интереса и дескрипторов. В: CIARP 2008, стр. 22–29 (2008)
Google ученый
Сабурин, Р., Женест, Г., Претё, Ф.: Спектр узоров как локальный форм-фактор для проверки подписи в автономном режиме. В: 13-й МКЗР, стр. 43–48 (1996)
. Google ученый
Шекар, Б.Х., Бхарати, Р.К.: Собственная подпись: надежный и эффективный алгоритм проверки подписи в автономном режиме. В: ICRTIT, стр. 134–138 (2011)
Google ученый
Варгас, Дж., Феррер, М., Травьесо, К., Алонсо, Дж.: Автономная проверка подписи на основе информации об уровне серого с использованием функций текстуры. PR 44(2), 375–385 (2011)
CrossRef МАТЕМАТИКА Google ученый
Алмазан Дж., Форнес А., Вальвени Э.: Метод выделения нежестких элементов для распознавания формы. В: ИКДАР, стр. 987–991. IEEE (2011)
Google ученый
Кумар, Р., Кунду, Л., Чанда, Б., Шарма, Д.Д.: Независимая от записи система проверки подписи в автономном режиме, основанная на морфологии подписи. В: ICIITM, стр. 261–265. АКМ (2010)
Google ученый
Рубнер, Ю., Томаси, К., Гибас, Л.: Расстояние землеройной машины как метрика для поиска изображений. Международный журнал компьютерного зрения 40(2), 99–121 (2000)
CrossRef МАТЕМАТИКА Google ученый
Шекар, Б.Х., Бхарати, Р.К., Шармилакумари, М.: Собственная подпись ядра: метод автономной проверки подписи, основанный на анализе основных компонентов ядра. В: EACV 2011 Двусторонний российско-индийский научный семинар, стр. 37–44 (2011)
Google ученый
Ссылки для скачивания
Информация об авторе
Авторы и организации
Факультет компьютерных наук, Мангалорский университет, Карнатака, Индия
B.H. Shekar
Факультет магистра компьютерных приложений, Инженерный колледж SJ, Майсур, Карнатака, Индия
R.K. Bharathi
Факультет магистра компьютерных приложений, AIMITna, St.
Mangalores , ИндияБхарати Пилар
Авторы
- Б. Х. Шекар
Просмотр публикаций автора
Вы также можете искать этого автора в PubMed Google Академия
- Р. К. Бхарати
Просмотр публикаций автора
Вы также можете искать этого автора в PubMed Google Scholar
- Bharathi Pilar
Просмотр публикаций автора
Вы также можете искать этого автора в PubMed Google Scholar
Информация для редакторов
Редакторы и филиалы
Подразделение машинного интеллекта, Индийский статистический институт, 203, Б.Т. Роуд, 700108, Калькутта, Индия
Прадипта Маджи, Ашиш Гхош, Кунтал Гош и Санкар К. Пал, , &
Департамент компьютерных наук и автоматизации, Индийский научный институт, 560012, Бангалор, Индия
М. Нарасимха Мурти Права
- 3
- и разрешения
Перепечатка и разрешения
Информация об авторских правах
© 2013 Springer-Verlag Berlin Heidelberg
Об этой статье
морфологических маркеров GeoMx — NanoString
Что такое морфологические маркеры?
Морфология исследует отношения между биологическими структурами.
Морфологические маркеры помогают выявить структурную архитектуру ткани и определить интересующие области (ROI).С помощью GeoMx DSP можно использовать флуоресцентно меченные антитела и/или РНК-зонды для информирования о наличии анатомических структур, типов клеток и компартментов, что помогает при выборе и сегментации ROI на отдельные биологические компартменты для дальнейшего многоуровневого цифрового профилирования. .
Как это работает
В системе флуоресцентной визуализацииGeoMx DSP используются светодиоды с наборами фильтров, ориентированными на стандартные каналы FITC, Cy3, Texas Red и Cy5. Пользователи могут окрашивать FFPE, свежезамороженные или фиксированно замороженные ткани морфологическими маркерами, чтобы маркировать тканевые компартменты и типы клеток и выбирать интересующие области (ROI) на основе биологии ткани. Используя встроенный алгоритм сегментации в программном обеспечении DSP, ROI могут быть автоматически разделены на дискретные биологические отсеки или области освещения (AOI) для точного профилирования и ответа на конкретные биологические вопросы.
Morphology Marker
InformationNanoString Morphology Marker Kits
NanoString Qualified & Verified Markers
NanoString TAP Morphology Markers
Community Verified Morphology Markers
Third Party Morphology Markers
NanoString Morphology Marker Kits
NanoString Morphology Marker Наборы
Эти морфологические маркеры обычно используются для профилирования опухолевых и иммунных компартментов или популяций нейронов. Эти антитела, конъюгированные с флуоресцентным красителем, проверены для различных тканей и анализов GeoMx на тканях мыши и человека. Эти наборы используются с набором для окрашивания нуклеиновых кислот SYTO 13. Файлы конфигурации Morphology Kit используются для автоматического заполнения ключевой целевой информации на этапе настройки сканирования GeoMx и могут быть загружены здесь.
Квалифицированные и проверенные маркеры NanoString
Квалифицированные и проверенные морфологические маркеры NanoString
Эти маркеры получены от наших партнеров, включая Abcam, Biolegend и других поставщиков, и протестированы в анализах GeoMx в соответствии с подходами «Квалифицировано» и «Проверено».
Квалифицированные маркерные тесты показали ожидаемую картину окрашивания, как правило, в одной ткани. Проверенные маркеры прошли более обширное тестирование на нескольких тканях, когда это было возможно, и использовались для сегментации ROI GeoMx. Более того, ориентируйтесь на специфическое положительное окрашивание тканей, подтвержденное опытным патологоанатомом.Морфологические маркеры NanoString TAP
Морфологические маркеры NanoString TAP
Программа доступа к технологиям (TAP) позволяет пользователям запускать небольшие пробные проекты. Благодаря этой работе программа разработала длинный список морфологических маркеров, которые хорошо работают с определенными тканями в определенных условиях. Список успешно использованных антител, зондов RNAscope и протестированных тканей был составлен, чтобы помочь пользователям в их исследовательских проектах: TAP-тестированные морфологические маркеры
Проверенные сообществом морфологические маркеры
Проверенные сообществом морфологические маркеры
Сообщество пользователей NanoString работает с широким спектром морфологических маркеров и типов тканей.
Мы составляем список предварительно проверенных маркеров, которые хорошо работали с определенными тканями нашими клиентами. Мы призываем наших пользователей делиться маркерами, которые успешно использовались в эксперименте GeoMx. Сообщите исследовательскому сообществу, отправив свои подтвержденные морфологические маркеры через форму 9 подтвержденных сообществом морфологических маркеров.0003Морфологические маркеры сторонних производителей
Морфологические маркеры сторонних производителей
Для целей морфологии РНК вы можете узнать о нашем совместном рабочем процессе с нашим партнером Advanced Cell Diagnostics (ACD) и о том, как выбрать подходящие комбинации зондов RNAscope: ACD и NanoString Partnership
Для маркеров морфологии антител рекомендуется начинать с тех, которые уже прошли валидацию для анализов IF/IHC нашими партнерами по антителам, Abcam или Biolegend, или другим поставщиком. После выбора важно, чтобы они были протестированы с использованием конкретных протоколов окрашивания, используемых для GeoMx.
Более подробную информацию см. в Руководстве по морфологическим маркерам.Таблицы технических данных мишеней Ячейка/структура Маркировка Виды / тип образца Флуорофор Поставщик Acta2 Фибробласты, гладкие мышцы, подвижность клеток Замороженная мышь АФ488 ТермоФишер Aqp1 Канал для воды Мышь FFPE АФ647 Абкам Эпкам Опухоли; эпителиальная ткань Мышь FFPE АФ488 Абкам Эпкам Опухоли; эпителиальная ткань Замороженная мышь АФ647 Абкам Гфап Глиальный фибриллярный кислый белок в зрелых астроцитах Замороженная мышь АФ647 Новус Гфап Глиальный фибриллярный кислый белок в зрелых астроцитах Замороженная мышь АФ594 Новус Гфап Глиальный фибриллярный кислый белок в зрелых астроцитах Мышь FFPE АФ532 Новус Гфап Глиальный фибриллярный кислый белок в зрелых астроцитах Мышь FFPE АФ488 Новус Гфап Глиальный фибриллярный кислый белок в зрелых астроцитах Мышь FFPE АФ647 Новус Гфап Глиальный фибриллярный кислый белок в зрелых астроцитах Мышь FFPE АФ647 Биолегенда Гфап Глиальный фибриллярный кислый белок в зрелых астроцитах Замороженная мышь АФ647 Биолегенда Гфап Глиальный фибриллярный кислый белок в зрелых астроцитах Замороженная мышь ДЛ594 Новус Гфап Глиальный фибриллярный кислый белок в зрелых астроцитах Замороженная мышь АФ532 Новус Гфап Глиальный фибриллярный кислый белок в зрелых астроцитах Замороженная мышь АФ532 Новус Гфап Глиальный фибриллярный кислый белок в зрелых астроцитах Замороженная мышь АФ647 Новус Гфап Глиальный фибриллярный кислый белок в зрелых астроцитах Мышь FFPE АФ647 Новус Гфап Глиальный фибриллярный кислый белок в зрелых астроцитах Мышь FFPE АФ594 Новус Иба1 Глиальные клетки Мышь FFPE АФ647 КНТ Иба1 Глиальные клетки Замороженная мышь АФ647 КНТ Ламинин (Пан-Ламинин) Базальная мембрана; внеклеточный матрикс Мышь FFPE АФ532 Новус Ламинин (Пан-Ламинин) Базальная мембрана; внеклеточный матрикс Мышь FFPE АФ488 Новус Карта2 Микротрубочки Мышь FFPE АФ647 Абкам Карта2 Микротрубочки Мышь FFPE АФ488 Абкам Мбит/с Основной белок миелина, все нейроны Мышь FFPE АФ647 Биолегенда Мбит/с Основной белок миелина, все нейроны Замороженная мышь АФ647 КНТ Мбит/с Основной белок миелина, все нейроны Замороженная мышь АФ594 КНТ Мых21 Гладкая мускулатура Мышь FFPE АФ647 Абкам Нефх Промежуточные филаменты, нейроны Мышь FFPE АФ594 Новус Нефх Промежуточные филаменты, нейроны Замороженная мышь АФ594 Новус Тдп43 Агрегаты в ALS Мышь FFPE АФ647 Абкам Табб3 Микротрубочки; Нейроны Мышь FFPE АФ647 Абкам Табб3 Микротрубочки; Нейроны Мышь FFPE АФ647 Биолегенда AQP1 Канал для воды FFPE человека АФ647 Абкам АРР/β-амилоид Бляшки головного мозга при болезни Альцгеймера FFPE человека АФ647 Новус CD103/ITGAE Внутриэпителиальные лимфоциты FFPE человека АФ647 Абкам CD20 В-клетки FFPE человека АФ647 Новус CD20 В-клетки FFPE человека АФ647 Абкам CD20 В-клетки FFPE человека АФ488 Абкам CD4 Большинство тимоцитов FFPE человека АФ647 Абкам CD57/B3GAT1 NK-клетки, CD8+ Т-клетки, нервные клетки, поперечно-полосатые мышцы FFPE человека АФ594 Биолегенда CD68 Макрофаги FFPE человека АФ488 Новус CD68 Макрофаги FFPE человека АФ647 Биолегенда CD68 Макрофаги FFPE человека АФ594 Новус CD8a Цитотоксические Т-лимфоциты FFPE человека АФ594 Биолегенда COL1A1 / Коллаген I Внеклеточный матрикс FFPE человека АФ647 Абкам ELA2 / Нейтрофильная эластаза Нейтрофилы FFPE человека АФ594 Новус ELA2 / Нейтрофильная эластаза Нейтрофилы FFPE человека АФ488 Новус GFAP Глиальный фибриллярный кислый белок в зрелых астроцитах FFPE человека АФ594 Новус GFAP Глиальный фибриллярный кислый белок в зрелых астроцитах FFPE человека АФ488 Новус GFAP Глиальный фибриллярный кислый белок в зрелых астроцитах Замороженный человек ДЛ594 Новус GFAP Глиальный фибриллярный кислый белок в зрелых астроцитах Замороженный человек АФ532 Новус GFAP Глиальный фибриллярный кислый белок в зрелых астроцитах Замороженный человек АФ532 Новус GFAP Глиальный фибриллярный кислый белок в зрелых астроцитах Замороженный человек АФ647 Новус GFAP Глиальный фибриллярный кислый белок в зрелых астроцитах Замороженный человек АФ647 Новус GFAP Глиальный фибриллярный кислый белок в зрелых астроцитах FFPE человека АФ594 Новус GFAP Глиальный фибриллярный кислый белок в зрелых астроцитах Замороженный человек АФ488 Новус HLA-G Трофобласты, эпителиальные клетки тимуса, опухоли FFPE человека АФ488 Санта-Крус IBA1 Глиальные клетки FFPE человека АФ647 КНТ IBA1 Глиальные клетки Замороженный человек АФ647 КНТ КРТ7 (цитокератин) Эпителиальные клетки FFPE человека АФ647 Абкам КРТ8/18 (цитокератин) Эпителиальные клетки FFPE человека АФ594 Новус Ламинин (Пан-Ламинин) Базальная мембрана FFPE человека АФ594 Новус КАРТА2 Микротрубочки FFPE человека АФ488 Абкам ПМБ Основной белок миелина, все нейроны FFPE человека АФ647 Биолегенда ПМБ Основной белок миелина, все нейроны Замороженный человек АФ647 КНТ НЭФХ Промежуточные филаменты, нейроны FFPE человека АФ647 Новус НЭФХ Промежуточные филаменты, нейроны FFPE человека АФ594 Новус НЭФХ Промежуточные филаменты, нейроны FFPE человека АФ594 Новус ОКЛН Плотные соединения FFPE человека АФ594 Новус ПД-1 Активированные Т- и В-клетки FFPE человека АФ647 Абкам Тау нейронов; Бляшки головного мозга при болезни Альцгеймера FFPE человека АФ647 Абкам Тау-Фосфо (T181) нейронов; Бляшки головного мозга при болезни Альцгеймера FFPE человека АФ594 Биолегенда Тау-Фосфо (T181) нейронов; Бляшки головного мозга при болезни Альцгеймера FFPE человека АФ488 Биолегенда Тау-Фосфо (S404) нейронов; Бляшки головного мозга при болезни Альцгеймера FFPE человека АФ488 КНТ Тау-Фосфо (T205) нейронов; Бляшки головного мозга при болезни Альцгеймера FFPE человека АФ488 КНТ ТУББ3 Микротрубочки в центральной и периферической нервной системе FFPE человека АФ647 Абкам АРР/β-амилоид Бляшки головного мозга при болезни Альцгеймера FFPE человека АФ647 КНТ АРР/β-амилоид Бляшки головного мозга при болезни Альцгеймера FFPE человека АФ594 КНТ АРР/β-амилоид Бляшки головного мозга при болезни Альцгеймера FFPE человека АФ488 КНТ CD163 Макрофаги и моноциты М2 FFPE человека АФ647 Абкам CD20 В-клетки FFPE человека АФ594 Новус CD3 Т-лимфоциты FFPE человека АФ647 Новус CD3 Т-лимфоциты FFPE человека АФ594 Новус CD3 Т-лимфоциты FFPE человека АФ532 Новус CD3 Т-лимфоциты FFPE человека АФ488 Новус CD31 Эндотелиальные клетки FFPE человека АФ647 Абкам CD31 Эндотелиальные клетки FFPE человека АФ488 Абкам CD68 Макрофаги FFPE человека АФ647 Санта-Крус CD68 Макрофаги FFPE человека АФ647 Новус CD68 Макрофаги FFPE человека АФ532 Новус GFAP Глиальный фибриллярный кислый белок в зрелых астроцитах FFPE человека АФ647 Новус Гфап Глиальный фибриллярный кислый белок в зрелых астроцитах Мышь FFPE АФ532 Новус HLA-G Трофобласты, эпителиальные клетки тимуса, опухоли FFPE человека АФ647 Санта-Крус IBA1 Глиальные клетки FFPE человека АФ594 КНТ КРТ (панцитокератин) Эпителиальные клетки FFPE человека АФ594 Новус КРТ (панцитокератин) Эпителиальные клетки FFPE человека АФ488 Новус Ламинин (Пан-Ламинин) Базальная мембрана FFPE человека АФ647 Новус ПМБ Основной белок миелина, все нейроны FFPE человека АФ647 КНТ ПМБ Основной белок миелина, все нейроны FFPE человека АФ488 КНТ ОКЛН Плотные соединения FFPE человека АФ647 Новус Гфап Глиальный фибриллярный кислый белок в зрелых астроцитах Мышь FFPE АФ532 Новус Гфап Глиальный фибриллярный кислый белок в зрелых астроцитах Мышь FFPE ДЛ594 Новус Гфап Глиальный фибриллярный кислый белок в зрелых астроцитах Мышь FFPE АФ488 Новус Иба1 Глиальные клетки Мышь FFPE АФ594 КНТ Иба1 Глиальные клетки Мышь FFPE АФ488 КНТ Мбит/с Основной белок миелина, все нейроны Мышь FFPE АФ647 КНТ AQP4 Канал для воды FFPE человека АФ488 Абкам CD11c Дендритные клетки (представляющие антиген) FFPE человека АФ488 Абкам CD68 Макрофаги Замороженный человек АФ488 Новус CD138 Цитоскелет-интерстициальный матрикс; Плазматические клетки, несколько опухолей FFPE человека АФ488 Биолегенда EPCAM Эпителиальные клетки, опухоли FFPE человека АФ647 Абкам Эпкам Эпителиальные клетки, опухоли Замороженная мышь АФ488 Абкам GFAP Глиальный фибриллярный кислый белок в зрелых астроцитах FFPE человека АФ488 Биолегенда Гфап Глиальный фибриллярный кислый белок в зрелых астроцитах Замороженная мышь АФ594 Биолегенда GFAP Глиальный фибриллярный кислый белок в зрелых астроцитах FFPE человека АФ647 Биолегенда GFAP Глиальный фибриллярный кислый белок в зрелых астроцитах Замороженный человек АФ647 Биолегенда GFAP Глиальный фибриллярный кислый белок в зрелых астроцитах FFPE человека АФ647 Новус GFAP Глиальный фибриллярный кислый белок в зрелых астроцитах Замороженный человек АФ488 Новус Гфап Глиальный фибриллярный кислый белок в зрелых астроцитах Замороженная мышь АФ488 Новус IBA1 Глиальные клетки FFPE человека АФ488 КНТ КРТ (панцитокератин) Эпителиальные клетки Замороженный человек АФ594 Новус Ламинин (Пан-Ламинин) Базальная мембрана Замороженная мышь АФ594 Новус Лгр5 Гиперэкспрессируется при раке яичников, толстой кишки и печени Мышь FFPE АФ594 Новус КАРТА2 Микротрубочки Замороженный человек АФ647 Абкам Мбит/с Основной белок миелина, все нейроны Мышь FFPE АФ488 КСТ ПМБ Основной белок миелина, все нейроны FFPE человека АФ594 КНТ Мбит/с Основной белок миелина, все нейроны Замороженный человек АФ594 КНТ Мбит/с Основной белок миелина, все нейроны Мышь FFPE АФ488 Биолегенда Мбит/с Основной белок миелина, все нейроны Замороженная мышь АФ647 Биолегенда МОГ Миелиновая оболочка FFPE человека АФ647 Абкам MUC1 Эпителиальный рак; секреторный эпителий FFPE человека АФ594 Новус MUC1 Эпителиальный рак; секреторный эпителий FFPE человека АФ647 Новус Нефх Промежуточные филаменты, нейроны Замороженная мышь АФ488 Новус Нефх Промежуточные филаменты, нейроны Замороженная мышь АФ532 Новус Нефх Промежуточные филаменты, нейроны Замороженная мышь АФ647 Новус ПД-1 Активированные Т- и В-клетки FFPE человека АФ647 Абкам ПД-Л1 Т- и В-клетки, многие опухолевые клетки FFPE человека АФ647 Абкам Тау-Фосфо (T181) нейронов; Бляшки головного мозга при болезни Альцгеймера Замороженная мышь АФ488 Биолегенда Тау-Фосфо (T181) нейронов; Бляшки головного мозга при болезни Альцгеймера Замороженная мышь АФ594 Биолегенда Тдп43 Агрегаты в ALS Замороженная мышь АФ594 Абкам ТДП43 Агрегаты в ALS FFPE человека АФ647 Абкам Тдп43 Агрегаты в ALS Замороженная мышь АФ647 Абкам Табб3 Микротрубочки в центральной и периферической нервной системе Замороженная мышь АФ647 Биолегенда ВИМ Промежуточные филаменты мезенхимального происхождения; саркомы FFPE человека АФ488 Абкам ВИМ Промежуточные филаменты мезенхимального происхождения; саркомы FFPE человека АФ594 Абкам ВИМ Промежуточные филаменты мезенхимального происхождения; саркомы Замороженный человек АФ594 Абкам Вим Промежуточные филаменты мезенхимального происхождения; саркомы Замороженная мышь АФ647 Абкам Вим Промежуточные филаменты мезенхимального происхождения; саркомы Замороженная мышь АФ594 Санта-Крус Вим Промежуточные филаменты мезенхимального происхождения; саркомы Мышь FFPE АФ594 Санта-Крус ТУББ3 Микротрубочки в центральной и периферической нервной системе FFPE человека АФ488 Абкам TNNI3 / Сердечный тропонин I Миокард FFPE человека АФ488 Абкам Тдп43 Агрегаты в ALS Мышь FFPE АФ594 Абкам Нейрональный маркер Мышь FFPE ПЭ Абкам ПД-Л1 Т- и В-клетки, многие опухолевые клетки FFPE человека АФ647 Абкам ПД-Л1 Т- и В-клетки, многие опухолевые клетки FFPE человека АФ647 Абкам Новый Постмитотические нейроны Мышь FFPE АФ647 Абкам ОЛИГ2 Олигодендроциты Замороженный человек АФ647 Абкам Новый Постмитотические нейроны FFPE человека АФ647 Абкам НЭФХ Промежуточные филаменты, нейроны Замороженный человек АФ488 Новус МГ21 Гладкая мускулатура FFPE человека АФ488 Абкам Мбит/с Основной белок миелина, все нейроны Мышь FFPE АФ594 Биолегенда ПМБ Основной белок миелина, все нейроны FFPE человека АФ594 Биолегенда Ли6Г Нейтрофилы Мышь FFPE АФ647 Новус ICOS Активированные Т-клетки FFPE человека АФ647 Абкам HLA-G Трофобласты, эпителиальные клетки тимуса, опухоли FFPE человека АФ594 Санта-Крус Гфап Глиальный фибриллярный кислый белок в зрелых астроцитах Мышь FFPE АФ647 Новус GFAP Глиальный фибриллярный кислый белок в зрелых астроцитах Замороженный человек АФ594 Биолегенда Эпкам Опухоли; эпителиальная ткань Мышь FFPE АФ647 Абкам ЭЛАВЛ4 / HUD Нейроны и олигодендроциты FFPE человека АФ647 Санта-Крус Е-кадгерин Слипчивые соединения, активный супрессор многих видов эпителиального рака Мышь FFPE АФ647 Фишер Э-кадгерин Слипчивые соединения; активный супрессор инвазии и роста многих эпителиальных раков FFPE человека АФ647 Фишер ДЕС Промежуточные филаменты скелетных, висцеральных и некоторых гладкомышечных клеток FFPE человека АФ647 Абкам С-комплект / CD117 Различные опухолевые клетки, дифференцирующие стромальные опухоли ЖКТ FFPE человека АФ647 Новус COL6A1 / Коллаген VI Внеклеточный матрикс FFPE человека АФ594 Абкам CD8a Цитотоксические Т-лимфоциты FFPE человека АФ647 Абкам CD8a Цитотоксические Т-лимфоциты FFPE человека АФ647 Биолегенда CD57/B3GAT1 NK-клетки, CD8+ Т-клетки, нервные клетки, поперечно-полосатые мышцы FFPE человека ФИТЦ Биолегенда CD4 Большинство тимоцитов . Замороженный человекАФ647 Абкам CD20 В-клетки FFPE человека АФ488 Новус CD163 Макрофаги и моноциты М2 FFPE человека АФ594 Абкам CD11c Дендритные клетки (представляющие антиген) FFPE человека АФ647 Абкам CD11c Дендритные клетки (представляющие антиген) FFPE человека АФ594 Абкам CD11b Клетки миелоидного происхождения FFPE человека АФ647 Новус ACTA2 Фибробласты, гладкие мышцы, подвижность клеток FFPE человека АФ647 Абкам Acta2 Фибробласты, гладкие мышцы, подвижность клеток Мышь FFPE АФ488 Абкам Acta2 Фибробласты, гладкие мышцы, подвижность клеток Мышь FFPE АФ594 ТермоФишер ACTA2 Фибробласты, гладкие мышцы, подвижность клеток FFPE человека АФ594 ТермоФишер ACTA2 Фибробласты, гладкие мышцы, подвижность клеток Замороженный человек АФ488 Абкам ACTA2 Фибробласты, гладкие мышцы, подвижность клеток FFPE человека АФ488 Абкам *Для получения подробной информации о клонах загрузите полный список здесь.
- и разрешения